1、集团公司对子公司的财务可以按如下方式管理：集中管理，收支两条线。子公司没有资金自主权，所有收支由总公司统一管理。收支两条线，所有收入一律上交总公司，所有支出由总公司统一拨付；分散式管理。子公司有经营自主权，所有收支自主决策，总公司只下达经营指标，不管收支情况；半统一模式。
2、对于企业集团而言，理想的财务组织划分应该是集权与分权适度、权责划分明确的多层级管理体系。财务管理管理部门的设置，应在遵循“统一领导、分级管理”原则的基础上，实现财务与会计职能的有效区分，实现部门的精简化设置。
3、在企业集团中，各子公司财务主管由母公司选派，向母公司负责；财务人员的人事关系、工资关系、福利待遇等均体现在母公司。由于财务部门相对独立于各子公司，有利于母公司对子公司进行有效的集权管理。以某集团为例，其财务人员集中办公，不下放到各子公司。
1、信息监管。一般要求子公司定期向母公司汇报人事、生产、运营和财务方面的信息，从而让母公司能够根据子公司的信息做出正确的决策，同时也在一定程度上对子公司的信息进行监控。财务控制。
2、股权控制。母公司对子公司的股权控制是指母公司借助于对子公司的资本投资，取得所有者或出资人的资格，再凭借这种资格以及所有权所赋予的控制权，对子公司进行战略、人事和财务控制。（2）战略控制。母公司对子公司所实施的战略控制包括经营控制和战略协调。
3、母公司对子公司的控制可以通过多种方式进行，包括财务管控、计划管控、人事管控等。其中，财务管控是母公司对子公司进行控制的重要手段之一。母公司可以通过对子公司财务部门的集中控制来把握各子公司的脉搏。
4、统一规章制度。首先，要统一子公司管理的规章制度，母公司和子公司的规章制度要一样，管理的方式也保持一致，这样便于母公司控制子公司的管理格局。统一财务系统。
一般来说，总公司财务部必须能够控制各分公司的财务部，包括人员任免、资金控制、制度设计等。如果分公司都能独立负责盈亏，业务性质互相之间很不一样，可以考虑授予当地财务人员比较大的权限。
总公司定期派内审人员进行合规审计，保证1-3的规定得到执行。除此之外，从组织架构上也可以让分子公司的财务人员直线汇报给总公司财务，虚线汇报给分子公司的一把手；即业务上支持分子公司，但是不归一把手管理。这样能保持财务的独立性，更有利于规章制度的有效执行。
总公司与分公司之间往来款是指企业在生产经营过程中，因发生供销产品、提供或接受劳务而形成的债权、债务关系的资金数额，如果是总公司与分公司之间的往来款，应该记入”其他应付款“科目里。
加强培养公司员工内部凝聚力及高度的责任心。分公司各项管理制度严格执行，并细化落实到每个人。分公司财务直接对总公司财务负责，严格执行收支两条线，资金支付实行月初预算、事中控制、月末对比差异分析。有效的沟通，追求人性化管理。
